尿的颜色是由尿液中的尿色素、尿红素和尿肌素决定的。
正常情况下，尿液是透明的柠檬色，清澈无杂质。但尿液颜色的深浅也和摄取的水分和食物有关，喝水越多颜色越浅。如果是吃了一定量的红萝卜和胡萝卜素、核黄素等，尿会变成黄色；吃甜菜等红色素的食物，尿会成浅红色甚至棕红色。
如果没有大量饮水，尿液象清水一样，且完全清而透明时，有可能是尿崩症引起的，如严重的糖尿病、慢性肾脏病，或脑下垂体病变，这时候就不能忽视它了。
尿液出现黄褐色，如隔夜的茶水一样，要当心胆红素尿，尿中出现胆红素，可能是肝脏损害的征兆，如甲肝、乙肝等各型肝炎，此外，胆管结石、寄生虫性胆管阻塞等也可能有此情况。尿色深如浓茶，可能是肝或胆囊疾病。因为肝或胆囊有病时，胆汁流入肠道的路线被阻断，只能由尿中排出，尿中的胆汁含量相对增多，故尿色加深。
尿液出现粉红色或者血色，如果不是食物或者药物引起的，就应该考虑泌尿系统肿瘤，尤其是老年人。如伴有腰部、下腹部绞痛，则应考虑泌尿系统结石。若伴有尿频、尿急、尿痛，则多为泌尿系统的感染；若伴有排尿困难，应考虑前列腺增生与膀胱结石。
暗绿色或蓝色尿，在排出了服用试剂、染料色素、药物以外，应考虑是否由于小肠阻塞、伤寒、腹膜炎等疾病引起的肠蠕动障碍或患有胃病如慢性胃炎胃癌、胃酸分泌减少等。
白色尿的情况有很多种，要根据情况区分。若尿中有奶絮一样的物质，主要是由血丝虫病引起的，另外，肿瘤、肾炎和先天性淋巴畸形也可以引起。如果尿中带有脂肪，常见于肾脂肪栓塞和长骨骨折。有时儿童出现米泔水样尿，多由于消化不良所致。若尿中似有酸性的白色物质，则应考虑生殖系统炎症感染，例如急性或慢性肾盂肾炎、膀胱炎、尿道炎、肾多发性脓肿、肾脓肿、肾结核、霉菌或寄生虫感染等。
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